Principales Versions
XF-104 : 2 protos avec Wright J65 engines, 1canon M61 Vulcan
YF-104A : pre-production (17 ex. utilisés pour tests)
F-104A : J-79-GE-3 - 2missiles AIM-9B (153 ex)
F-104B : F-104A en tandem 2 sièges pour entraînement (26 ex)
F-104C : Chasseur-Bombardier capble d'emporter les bombes nucléaires MK28 et 43, ravitaillement en vol, (77 ex.)- J79-GE-7
F-104G : 1122 ex. : sous licence 210 (RFA) 164(Italie) 231 (P- B) 140(Canadair) 188(Sabca) 50 (MBB) - structure fuselage et ailes renforcée, J-79-GE-11A, 2 missiles antinavires.
TF-104G : version entraînement . 220 ex.
F-104J : 210 ex. intercepteur (F-104G) pour le Japon
J-79-IHI-11A, 4 AIM-9 Sidewinder
F-104N : 3 F-104G livrés à la Nasa.
F-104S : 246 ex produit par Fiat - J79-GE-19, 2 Sparrow III
CF-104 : 200 ex. construits par Canadair (Canadian J79-OEL-7 engines)
CF-104D : 38 ex. version entraînement du CF-104